Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms