Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms