Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E9PBE3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E9PBE3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E9PBE3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
E9PBE3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E9PBE3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E9PBE3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E9PBE3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E9PBE3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E9PBE3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E9PBE3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E9PBE3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E9PBE3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E9PBE3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E9PBE3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E9PBE3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E9PBE3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E9PBE3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E9PBE3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E9PBE3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E9PBE3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E9PBE3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E9PBE3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E9PBE3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E9PBE3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E9PBE3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E9PBE3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E9PBE3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms