Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4E171 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4E171 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
B4E171 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
B4E171 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4E171 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4E171 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
B4E171 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4E171 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4E171 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4E171 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4E171 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4E171 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4E171 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4E171 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4E171 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4E171 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4E171 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4E171 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4E171 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4E171 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4E171 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
B4E171 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4E171 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4E171 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4E171 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4E171 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4E171 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4E171 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4E171 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4E171 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4E171 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4E171 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4E171 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4E171 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4E171 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4E171 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4E171 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4E171 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4E171 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4E171 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4E171 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4E171 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4E171 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
B4E171 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4E171 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4E171 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4E171 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4E171 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4E171 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4E171 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4E171 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4E171 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4E171 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4E171 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4E171 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4E171 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4E171 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4E171 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4E171 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4E171 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4E171 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4E171 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
B4E171 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4E171 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4E171 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4E171 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms