Protein–RNA interactions for Protein: B3KWA1

IDS, Iduronate 2-sulfatase (Hunter syndrome), isoform CRA_e, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDSB3KWA1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDSB3KWA1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms