Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WASHC1A8K0Z3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
WASHC1A8K0Z3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms