Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms