Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms