Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIPSLA2A3N6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms