Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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