Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms