Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX8Q9Y5X2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms