Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF330Q9Y3S2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms