Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPS5Q9UPZ3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS5Q9UPZ3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms