Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCML1Q9UN30 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms