Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO4Q9UKT5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms