Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCAN3Q9UKA8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms