Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms