Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms