Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLIP2Q9UDT6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms