Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms