Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms