Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC180Q9P1Z9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms