Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms