Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms