Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms