Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms