Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX14

NDUFB11, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB11Q9NX14 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFB11Q9NX14 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms