Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT57Q9NWB7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms