Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms