Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms