Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms