Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TM7SF3Q9NS93 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms