Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
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