Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMMDC1Q9NPL8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms