Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FZD3Q9NPG1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms