Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMURF2Q9HAU4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms