Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms