Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H9

SRCIN1, SRC kinase signaling inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCIN1Q9C0H9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRCIN1Q9C0H9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SRCIN1Q9C0H9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SRCIN1Q9C0H9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SRCIN1Q9C0H9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCIN1Q9C0H9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCIN1Q9C0H9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCIN1Q9C0H9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCIN1Q9C0H9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCIN1Q9C0H9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCIN1Q9C0H9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCIN1Q9C0H9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCIN1Q9C0H9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCIN1Q9C0H9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCIN1Q9C0H9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCIN1Q9C0H9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCIN1Q9C0H9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCIN1Q9C0H9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCIN1Q9C0H9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCIN1Q9C0H9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCIN1Q9C0H9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCIN1Q9C0H9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCIN1Q9C0H9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCIN1Q9C0H9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCIN1Q9C0H9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCIN1Q9C0H9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCIN1Q9C0H9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRCIN1Q9C0H9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms