Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms