Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms