Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms