Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNG6Q9BXT2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms