Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms