Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
POLR3CQ9BUI4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3CQ9BUI4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms