Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms