Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLF1Q9BQI6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms