Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYD88Q99836 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms