Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL13Q99616 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL13Q99616 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL13Q99616 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL13Q99616 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL13Q99616 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL13Q99616 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL13Q99616 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL13Q99616 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL13Q99616 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL13Q99616 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL13Q99616 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL13Q99616 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL13Q99616 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL13Q99616 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL13Q99616 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL13Q99616 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL13Q99616 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL13Q99616 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL13Q99616 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL13Q99616 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms