Protein–RNA interactions for Protein: Q99578

RIT2, GTP-binding protein Rit2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT2Q99578 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms